En este segundo volumen de la Historia de la Ciencia se presenta una exposición de la evolución de las ideas sobre el método científico y las críticas de los principios fundamentales del sistema del siglo XIII realizadas desde finales del siglo XII al XV, lo que preparó el camino para cambios más radicales en los siglos XVI y XVII. El último apartado está dedicado a la propia Revolución científica: «La aplicación de los métodos matemáticos a la Mecánica», «La Astronomía y la nueva Mecánica», «Anatomía y morfología y embriología animales comparadas», «Filosofía de la Ciencia y concepto de la Naturaleza en la revolución científica», etcétera.